根据中央和省委、省政府部署要求，莫干山研究院通过资源整合，结合“浙江碳中和创新研究院”碳监测、碳转化与应用、双碳战略三大核心领域，筹建莫干山碳中和创新中心，致力于打造国内有影响力的绿色能源技术领域科创战略平台，建成区域标志性“双碳”高地。当前，莫干山碳中和创新中心建有双碳监测实验室/大气环境与全球变化实验室（县级重点实验室）、绿色氢能技术实验室（县级重点实验室）、CO2绿色转化及功能化应用实验室、碳资源绿色催化转化实验室和耦合减废降碳智慧能源系统实验室。